Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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