Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNS3Q68CZ2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNS3Q68CZ2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNS3Q68CZ2 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNS3Q68CZ2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNS3Q68CZ2 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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TNS3Q68CZ2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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TNS3Q68CZ2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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TNS3Q68CZ2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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TNS3Q68CZ2 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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TNS3Q68CZ2 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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TNS3Q68CZ2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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TNS3Q68CZ2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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TNS3Q68CZ2 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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TNS3Q68CZ2 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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TNS3Q68CZ2 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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TNS3Q68CZ2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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TNS3Q68CZ2 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNS3Q68CZ2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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