Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms