Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms