Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms