Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms