Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms