Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms