Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms