Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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PTPRNQ16849 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PTPRNQ16849 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PTPRNQ16849 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PTPRNQ16849 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PTPRNQ16849 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PTPRNQ16849 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PTPRNQ16849 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PTPRNQ16849 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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