Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms