Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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