Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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NCOA1Q15788 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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NCOA1Q15788 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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NCOA1Q15788 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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NCOA1Q15788 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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NCOA1Q15788 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
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NCOA1Q15788 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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NCOA1Q15788 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
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