Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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RFTN1Q14699 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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RFTN1Q14699 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFTN1Q14699 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RFTN1Q14699 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RFTN1Q14699 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RFTN1Q14699 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RFTN1Q14699 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
RFTN1Q14699 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RFTN1Q14699 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RFTN1Q14699 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RFTN1Q14699 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RFTN1Q14699 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RFTN1Q14699 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RFTN1Q14699 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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