Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CBFBQ13951 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CBFBQ13951 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CBFBQ13951 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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CBFBQ13951 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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CBFBQ13951 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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CBFBQ13951 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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CBFBQ13951 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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CBFBQ13951 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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