Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 AC010203.1-201ENST00000548404 928 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 LINC01892-202ENST00000583985 540 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 TPT1-AS1-221ENST00000618947 520 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 AC013402.3-201ENST00000438566 451 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 AC096732.1-201ENST00000439565 477 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 IL12A-AS1-201ENST00000462431 988 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CAMK2BQ13554 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms