Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TCOF1Q13428 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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