Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms