Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RLFQ13129 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RLFQ13129 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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