Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FOXF1Q12946 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FOXF1Q12946 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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