Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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TRAF2Q12933 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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TRAF2Q12933 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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TRAF2Q12933 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF2Q12933 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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TRAF2Q12933 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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TRAF2Q12933 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF2Q12933 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF2Q12933 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF2Q12933 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF2Q12933 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF2Q12933 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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