Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIF5AQ12840 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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