Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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