Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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