Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms