Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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