Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms