Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms