Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms