Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms