Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms