Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms