Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms