Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 NEXMIF-201ENST00000055682 11719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 GNB5-201ENST00000261837 8906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CUL9-201ENST00000252050 7780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CHIC1-202ENST00000373504 6797 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AR-203ENST00000396044 10221 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 DOCK6-201ENST00000294618 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms