Protein–RNA interactions for Protein: P59046

NLRP12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP12P59046 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NLRP12P59046 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms