Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms