Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMD8P48556 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms