Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLMP48507 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCLMP48507 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms