Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms