Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMPOP42166 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMPOP42166 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms