Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms