Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms