Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms