Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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PTPRMP28827 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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PTPRMP28827 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
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PTPRMP28827 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
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PTPRMP28827 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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PTPRMP28827 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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PTPRMP28827 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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PTPRMP28827 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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