Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PEX2P28328 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PEX2P28328 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PEX2P28328 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms