Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTSSP25774 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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CTSSP25774 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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CTSSP25774 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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