Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms