Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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