Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRCP23327 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRCP23327 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRCP23327 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRCP23327 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRCP23327 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRCP23327 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRCP23327 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRCP23327 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HRCP23327 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HRCP23327 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HRCP23327 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HRCP23327 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HRCP23327 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HRCP23327 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HRCP23327 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HRCP23327 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HRCP23327 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HRCP23327 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRCP23327 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRCP23327 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HRCP23327 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HRCP23327 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HRCP23327 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HRCP23327 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HRCP23327 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HRCP23327 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HRCP23327 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HRCP23327 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HRCP23327 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HRCP23327 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HRCP23327 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HRCP23327 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HRCP23327 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms