Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CXCL3P19876 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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